System Embryo to dwa zintegrowane ze sobą funkcjonalnie moduły - panel embriologiczny stanowiący trzon systemu oraz moduł andrologiczny, w którym realizowane są wszystkie operacje związane z rejestracją dawców męskich komórek rozrodczych oraz ich opisem.
W panelu, do którego dostęp mają androlodzy zatrudnieni w ośrodku możliwe jest wprowadzanie oraz przeglądanie informacji dotyczących danych podstawowych dawcy (w tym jego danych fenotypowych) oraz danych szczegółowo opisujących jakość nasienia i jego ewentualną kriokonserwację. W module tym rejestrowane są również dane laboratoryjne pozwalające automatycznie wyznaczać okna serologiczne. Panel andrologiczny to również zintegrowany z nim bank nasienia.
Moduł andrologiczny posiada funkcjonalność pozwalającą na wydruk kompletu dokumentów załączanych do dokumentacji medycznej. Każdy wydruk jest identyfikowany unikalnym dwuwymiarowym kodem, pozwalającym szybko i wygodnie za pomocą czytnika kodów odnaleźć w systemie powiązane dane. Blok andrologiczny pozwala również na wydruk dedykowanych etykiet znamionowych wykorzystywanych w kriokonserwacji do znakowania próbówek z nasieniem.